利用大规模平行滴定曲线测量抗体的序列-亲和力景观
定量方法
2018-04-16 v2 生物大分子
摘要
尽管抗体在适应性免疫系统和生物技术中扮演着核心角色，但关于抗体的氨基酸序列与其抗原结合亲和力之间的定量关系仍知之甚少。在此，我们描述一种称为 Tite-Seq 的新实验方法，其能够并行测量数千种变异抗体的结合滴定曲线及相应的亲和力。滴定曲线的测量消除了标准深度突变扫描测定中出现的抗体表达与稳定性的混杂效应。我们在已充分研究的 scFv 抗体的 CDR1H 和 CDR3H 区域上演示了 Tite-Seq。我们的数据揭示了抗原结合亲和力的结构基础，并提示二级 CDR 环在确立抗体稳定性中的作用。Tite-Seq 填补了测量适应性免疫系统关键方面的能力上的巨大空白，并可轻易用于研究其他蛋白质系统中的序列-亲和力景观。
引用
@article{arxiv.1601.02160,
title = {Measuring the sequence-affinity landscape of antibodies with massively parallel titration curves},
author = {Rhys M. Adams and Thierry Mora and Aleksandra M. Walczak and Justin B. Kinney},
journal= {arXiv preprint arXiv:1601.02160},
year = {2018}
}