拟南芥生物钟的数学模型
生物物理
2024-05-29 v1 斑图形成与孤子
分子网络
摘要
我们回顾了拟南芥生物钟数学模型的构建与演变，将讨论结构化为建模策略的两个不同历史阶段：扩展与约简。扩展阶段探索了调控网络的自下而上组装，引入尽可能多的组分和相互作用，以捕捉生物钟的振荡特性。约简阶段则涉及功能分解，将复杂模型提炼为其基本的动力学库。还讨论了该领域当前的挑战，包括空间考量以及光和温度等环境影响的整合。本综述强调了在分子细节与实际简洁性之间取得平衡的模型的持续需求。
引用
@article{arxiv.2405.18006,
title = {Mathematical models of the Arabidopsis circadian oscillator},
author = {Lucas Henao and Saúl Ares and Pablo Catalán},
journal= {arXiv preprint arXiv:2405.18006},
year = {2024}
}