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基于机器学习引导的 DNA 无机纳米颗粒多尺度设计用于靶向自组装双 gyroid 结构

生物物理 2026-01-13 v1 软凝聚态物质

摘要

在软物质科学中,人们常希望设计具有特定目标性质的新材料。这些材料可用于许多应用,每个应用都需要针对最大适配度进行特定特征的优化。自组装过程——从 suitably 设计的构建块实现目标结构——是一种强大的优化工具。然而,如何一般性地设计可实现的构建块以实现所需相仍是一个开放问题。本文选择双 gyroid 作为目标结构,将 DNA 功能化纳米颗粒作为构建块。借助现有的偶-偶势为灵感,定义了大范围的设计空间用于探索目标结构。实现了有效的搜索策略:首先用于粗化原细粒度模型的构建块,然后快速评估每个设计的适配度。将这些数据输入机器学习算法,通过主动学习循环获得对设计空间中所有候选方案的预测。识别出成功的粗化设计,并通过细粒度模型中的界面固定计算进行再评估。这一工作导致开发了特定的、可实验验证的 DNA 功能化纳米颗粒的设计,这些设计可自组装形成目标相。所用方法可扩展到其他类型的构建块和目标结构。

关键词

引用

@article{arxiv.2507.03025,
  title  = {Machine Learning Guided Multiscale Design of DNA-functionalized Nanoparticles for Targeted Self-Assembly of the Double Gyroid},
  author = {Luis Nieves-Rosado and Fernando Escobedo},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2507.03025},
  year   = {2026}
}

备注

29 pages, 5 figures