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在石墨烯台阶纳米孔中锁定 ssDNA 并通过电触发逐步操控其传输

生物物理 2015-09-08 v1

摘要

本研究证明,构建在多层石墨烯片上的纳米孔台阶可用于控制单链 DNA(ssDNA)的构象与传输以实现纳米孔测序。当吸附在台阶状石墨烯纳米孔上时,ssDNA 在纳米孔附近无面内摆动,并能在拉伸构象下被锁定在石墨烯台阶上。在偏置下,纳米孔附近积累的离子促进了被锁定 ssDNA 的易位,同时也扰乱了孔内核苷酸所受驱动力与阻力的平衡。研究发现触发 ssDNA 易位启动需要一临界力,这意味着台阶状石墨烯纳米孔具有固有场效应。通过改变作为触发信号的电场强度,可在单核苷酸水平上操控纳米孔内 ssDNA 的停止与行进。ssDNA 在纳米孔中的速度也可由电刺激频率调节。因此,通过引入控制器与触发器,实现了石墨烯纳米孔中 ssDNA 可控易位的新方案,值得更多实验探索。

关键词

引用

@article{arxiv.1509.02078,
  title  = {Locking ssDNA in a Graphene-Terraces Nanopore and Steering Its Step-by-Step Transportation via Electric Trigger},
  author = {Wenping Lv and Jiaxi Peng and Dongsheng Xu and Renan Wu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1509.02078},
  year   = {2015}
}

备注

7 pages, 7 figures