多亚基酶中变构信号转导与功能动力学的联系：S-腺苷高半胱氨酸水解酶

S-腺苷高半胱氨酸水解酶（SAHH）是一种细胞酶，在甲基化反应（包括病毒 mRNA 成熟所需的甲基化反应）中起关键作用，是发现抗病毒药物过程中的重要药物靶点。虽然靶向活性位点是酶抑制的一种直接策略，但许多酶中活性位点受变构调控的证据揭示了信号转导的分子起源。SAHH 家族中共进化序列的信息以及利用该酶天然拓扑可识别的功能动力学关键残基，为我们提供了如何理解分散于分子结构中的变构信号网络协调亚基内与亚基间构象动力学的线索。为了研究 SAHH 的变构通讯与功能动力学之间的联系，我们基于全酶及配体结合结构构建了粗粒化模型，并进行了布朗动力学模拟。配体诱导转变的模拟结果显示，亚基内闭合动力学的信号被传递以形成亚基间接触，进而引发活性位点的精确对准，随后发生二聚体-二聚体旋转，使整个四聚体结构变得更为紧密。对 SAHH 与配体结合相关动力学的进一步分析提供了诱导契合与群体转移机制共同存在的证据，并表明过渡态系综类似于配体结合态。除了在活性位点形成酶-配体接触外，远离活性位点的残基所产生的变构耦合对酶的功能也至关重要。