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哺乳动物进化中脆弱区域的有限寿命

基因组学 2010-11-02 v1 种群与进化 定量方法

摘要

基因组进化中的一个重要问题是是否存在脆弱区域(重排热点),染色体重排在这些区域反复发生。尽管几乎所有近期研究都支持哺乳动物基因组中存在脆弱区域,但最全面的哺乳动物系统发育基因组学研究(Ma et al. (2006) Genome Research 16, 1557-1565)对其存在性提出了一些质疑。我们证明脆弱区域经历了一个“诞生与死亡”的过程,这意味着脆弱性具有有限的进化寿命。这一发现表明,脆弱区域在不同哺乳动物中迁移到不同位置,从而解释了为什么不同谱系之间只有少数染色体断点共享。脆弱区域的诞生与死亡现象强化了重排由匹配的片段重复促进的假说,并提示了人类基因组中当前活跃脆弱区域的假定位置。

关键词

引用

@article{arxiv.1011.0200,
  title  = {Limited Lifespan of Fragile Regions in Mammalian Evolution},
  author = {Max A. Alekseyev and Pavel A. Pevzner},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1011.0200},
  year   = {2010}
}