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大语言模型在生物信息学中的应用:综述

计算与语言 2026-03-03 v3 基因组学

摘要

大语言模型(LLMs)正在彻底变革生物信息学,通过对 DNA、RNA、蛋白质和单细胞数据进行高级分析。本综述提供了近期进展的系统性综述,聚焦基因组序列建模、RNA 结构预测、蛋白质功能推断和单细胞转录组分析。与此同时,我们还讨论了若干关键挑战,包括数据稀缺、计算复杂度和跨组学集成,并探讨未来方向如多模态学习、混合 AI 模型和临床应用。通过提供全面的视角,本文凸显了 LLMs 在推动生物信息学和精准医学创新方面的变革性潜力。

关键词

引用

@article{arxiv.2503.04490,
  title  = {Large Language Models in Bioinformatics: A Survey},
  author = {Zhenyu Wang and Zikang Wang and Jiyue Jiang and Pengan Chen and Xiangyu Shi and Yu Li},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2503.04490},
  year   = {2026}
}

备注

Accepted by ACL 2025