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非平衡分子动力学模拟中基于动能的温度计算

计算物理 2009-12-23 v1

摘要

在分子动力学(MD)模拟中,平均动能被广泛用于表征温度。本文研究了三种平均动能作为温度度量的适用性,即总动能、去除质心平动部分的动能以及热扰动动能。我们的 MD 模拟表明,基于包含刚体平动或转动动能的温度定义可能会产生不切实际的结果。相比之下,热扰动动能在非平衡分子动力学模拟的温度计算中具有更广泛的适用性。若需使用小样本计算局部温度,则提出了一种校准方法来消除平均扰动动能对样本尺寸的依赖性。

关键词

引用

@article{arxiv.0912.4393,
  title  = {Kinetic Energy-Based Temperature Computation in Non-Equilibrium Molecular Dynamics Simulation},
  author = {Bin Liu and Ran Xu and Xiaoqiao He},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0912.4393},
  year   = {2009}
}

备注

4 figures