通过纳米孔和跨膜通道的离子通量
软凝聚态物质
2012-03-13 v3 生物物理
生物大分子
摘要
我们引入了一种隐式溶剂分子动力学方法，用于计算通过狭窄纳米孔和跨膜通道的离子通量。该方法依赖于双控制体积巨正则分子动力学（DCV-GCMD）模拟以及Levin最近获得的圆柱形纳米孔内静电势的解析解[Europhys. Lett., 76, 163 (2006)]。该理论用于计算通过模拟抗菌短杆菌肽A通道的人工跨膜通道的离子通量。我们在各种实验条件下计算了电流-电压和电流-浓度关系。我们表明，我们的结果与短杆菌肽A孔的特征相当，特别是孔内存在两个结合位点以及观测到的电流-浓度曲线中的饱和现象。
引用
@article{arxiv.1108.5366,
title = {Ion fluxes through nano-pores and transmembrane channels},
author = {José Rafael Bordin and Alexandre Diehl and Marcia C. Barbosa and Yan Levin},
journal= {arXiv preprint arXiv:1108.5366},
year = {2012}
}
备注
15 pages, 8 figures, accepted for publication in Physical Review E