通过分子动力学模拟中的镜像电荷溶剂化方法(ICSM)研究 KcsA 通道的选择性
生物大分子
2016-05-04 v1
摘要
本文通过一种最近发展的镜像电荷溶剂化方法（ICSM）结合分子动力学模拟，研究了钾通道 KcsA 的选择性。ICSM 中的杂化溶剂化模型能够在原子层面上展示当考虑钾离子和钠离子并模拟它们在过滤器内分布时 KcsA 通道选择性过滤器的功能。我们的研究还表明，在 ICSM 模型中通过镜像电荷近似显式考虑的 reaction field 效应，对于重现钾通道正确的选择性性质是必要的。
引用
@article{arxiv.1510.04579,
title = {Investigating the Selectivity of KcsA Channel by an Image Charge Solvation Method (ICSM) in Molecular Dynamics Simulations},
author = {Katherine Baker and Duan Chen and Wei Cai},
journal= {arXiv preprint arXiv:1510.04579},
year = {2016}
}