自催化蛋白质自组装动力学中的固有变异性
软凝聚态物质
2014-08-28 v3 统计力学
生物物理
生物大分子
摘要
在小体积中，丝状蛋白质自组装的动力学预计会表现出显著的变异性，这源于固有的分子噪声。现有的确定性模型并未考虑这一点。我们引入了一种简单的随机模型，包含成核以及通过延伸和断裂进行的自催化生长，使我们能够预测分子噪声对自催化自组装动力学的影响。我们推导出了滞后时间分布的解析表达式，该表达式与牛胰岛素纤维化的实验结果吻合良好。我们的表达式将滞后时间的变异性分解为来自初级成核和自催化生长的贡献，并揭示了它们如何随关键动力学参数缩放。我们的分析表明，显著的滞后时间变异性可能源于初级成核和自催化生长，这为从小体积实验中提取早期聚集的机制信息提供了一种方法。
引用
@article{arxiv.1402.4021,
title = {Inherent variability in the kinetics of autocatalytic protein self-assembly},
author = {Juraj Szavits-Nossan and Kym Eden and Ryan J. Morris and Cait E. MacPhee and Martin R. Evans and Rosalind J. Allen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1402.4021},
year = {2014}
}
备注
5pp, 3 fig. + Supp. Mat. (7pp, 4 fig.), accepted for publication in PRL