基于定量检测的有信息池化检测
统计方法学
2020-11-03 v1
摘要
当个体检测不具备成本效益时，池化检测被广泛用于筛查低流行率的病毒或细菌感染。基于给出二元结果的定性检测的池化检测已被充分研究。然而，定量检测下池化的特性多通过模拟或实证研究展示。我们研究了三种定量检测池化策略的性质：传统两阶段迷你池化（MP）（Dorfman, 1943）、带解卷积算法的迷你池化（MPA）（May et al., 2010）以及标记辅助MPA（mMPA）（Liu et al., 2017）。MPA与mMPA在池检测阳性后按顺序检测个体，并实施解卷积算法以确定何时可停止检测以确认所有个体状态。mMPA利用其他可用标记的信息确定个体检测的最优顺序。我们推导并比较了三种池化方法的一般统计性质。我们表明，在适当池大小下，MP、MPA与mMPA可比个体检测更具成本效益，且mMPA优于MPA与MP。在诊断准确性方面，mMPA与MPA比MP与个体检测具有更高的特异度与阳性预测值，但灵敏度与阴性预测值更低。本文包含多种模拟应用及一项用于HIV治疗监测的应用。
引用
@article{arxiv.2011.00404,
title = {Informed Pooled Testing with Quantitative Assays},
author = {Tao Liu and Joseph W Hogan and Wanning Su and Yizhen Xu and Michael J Daniels and Kantor Rami},
journal= {arXiv preprint arXiv:2011.00404},
year = {2020}
}