蛋白质字母表的资讯路径：氨基酸的熵分类
生物大分子
2007-11-05 v4 生物物理
定量方法
摘要
作为活细胞蛋白质机器工作部件的蛋白质由什么构成？要回答此问题，我们需要一种将蛋白质拆解为基本功能细节并制备此类细节归总描述的技术。此归总描述可能具有多重物质实现（于氨基酸中）。我们的假说是，对此问题的资讯学路径是可能的。我们提出一种使蛋白质一级结构最大非随机的层次分类法。所建议研究纲领的初步步骤已实现：方法与最优资讯蛋白质二值字母板分析。该一般方法用于回答若干具体问题，例如：(i) 球状与膜蛋白间是否存在句法差异？(ii) 蛋白质是氨基酸的随机序列吗（一长久讨论）？对这些问题的回答如下：(i) 球状与膜蛋白间存在显著句法差异，且此差异被描述；(ii) 蛋白质中的氨基酸序列绝对非随机。
引用
@article{arxiv.q-bio/0501019,
title = {Informational Way to Protein Alphabet: Entropic Classification of Amino Acids},
author = {A. N. Gorban and M. Kudryashev and T. Popova},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0501019},
year = {2007}
}
备注
13 p. 6 Tabs, 3 Figs, Reduced version with additional study of membrane and globular proteins