中文

推断网络机制:以黑腹果蝇蛋白质相互作用网络为例

定量方法 2009-11-10 v1 分子网络

摘要

自然形成的网络展现出揭示潜在生长机制的定量特征。近来已提出众多网络机制以重现如度分布或聚类系数等特定性质。我们提出一种利用机器学习中的判别工具,推断最能准确刻画给定网络拓扑之机制的方法。黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)蛋白质网络被可信且稳健地(对噪声和训练数据子采样具有鲁棒性)分类为优先连接、小世界及其他复制-突变机制之上的复制-突变-互补网络。系统性分类而非针对特定性质的统计研究,为理解复杂网络的设计提供了判别性途径。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0408010,
  title  = {Inferring Network Mechanisms: The Drosophila melanogaster Protein Interaction Network},
  author = {Manuel Middendorf and Etay Ziv and Chris Wiggins},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0408010},
  year   = {2009}
}

备注

19 pages, 5 figures