从家庭结构症状发作数据推断人群水平的疾病传播力
种群与进化
2021-11-22 v1
摘要
首批少数 X（FFX）研究在疫情早期收集按家庭分层的数据，以推断新发疾病的严重性与传播力。我们提出一种贝叶斯方法，首次从此类数据近似推断人群水平的传播力；以往研究仅推断家庭水平的传播力。为此，我们在两个层面进行推断，假设一个用于家庭内感染的传播率参数，以及另一个用于不同家庭间感染的传播率参数。我们使用一个简化假设：家庭间感染总是发生在未受感染家庭中；同时仍对家庭内感染参数进行完整的联合推断。此外，采用一种新技术以消除当每日新感染数增长或衰减时（真实疫情中常见）的系统性偏差，而无需同时估计序列间隔。该方法在模拟数据上得到验证，即使感染家庭数量相对较少时也表现良好。
引用
@article{arxiv.2111.10020,
title = {Inference of population-level disease transmissibility from household-structured symptom onset data},
author = {P. G. Ballard and A. J. Black and J. V. Ross},
journal= {arXiv preprint arXiv:2111.10020},
year = {2021}
}
备注
38 pages, 8 figures. Submitted to Mathematical Biosciences