在真菌系统学中整合分子数据：给有志研究者的指南
种群与进化
2013-02-15 v1 基因组学
摘要
过去二十年见证了分子数据成为真菌学大多数分支的主要研究工具。随着 DNA 测序技术的不断改进，真菌系统学、分类学和生态学均取得了巨大进步，并经历了快速而深远的变革。一项利用分子数据的分类学研究涉及一系列漫长的步骤，从类群采样到各种实验室程序、数据分析，直至发表过程。所有步骤都很重要，并影响结果及其被科学界感知的方式。本文对此类项目中的所有主要步骤进行了反思性概述，旨在协助即将开始使用基于 DNA 方法的首项研究的研究学生。我们还借此机会讨论了在分子数据背景下，分类学在生物学乃至整个生命科学中的作用。虽然学习分子方法的最佳方式是与其经验丰富者并肩工作，但我们希望本文能降低读者的学习门槛。
引用
@article{arxiv.1302.3244,
title = {Incorporating molecular data in fungal systematics: a guide for aspiring researchers},
author = {Kevin D. Hyde and Dhanushka Udayanga and Dimuthu S. Manamgoda and Leho Tedersoo and Ellen Larsson and Kessy Abarenkov and Yann J. K. Bertrand and Bengt Oxelman and Martin Hartmann and Håvard Kauserud and Martin Ryberg and Erik Kristiansson and Henrik R. Nilsson},
journal= {arXiv preprint arXiv:1302.3244},
year = {2013}
}
备注
Submitted to Current Research in Environmental and Applied Mycology - comments most welcome