显照射蛋白质动力学：计算方法综述
化学物理
2025-03-28 v1 生物物理
摘要
光活性蛋白质吸收光子后发生结构变化，以完成必需的生物学功能。这些蛋白质对于理解光诱导的生物学过程至关重要，在生物力学、生物技术和医学领域具有重要意义。探索光活性过程的有效方法之一是通过计算方法。这些技术提供了蛋白质吸收光子后结构、电子和动力学变化的原子水平见解。通过运用这些方法，我们可以更好地地理解那些在实验中难以捕捉的过程，例如染料异构化和蛋白质构象变化。本综述提供了不同光活性蛋白质家族及其计算方法的概览，包括生物信息学、分子动力学和增强抽样。我们的综述可作为计算方法探索光激活分子过程的介绍，特别针对刚开始在该领域探索的研究者。
引用
@article{arxiv.2503.21418,
title = {Illuminating Protein Dynamics: A Review of Computational Methods for Studying Photoactive Proteins},
author = {Sylwia Czach and Jakub Rydzewski and Wiesław Nowak},
journal= {arXiv preprint arXiv:2503.21418},
year = {2025}
}