DNA 序列如何影响转录响应的 Hill 曲线

Hill 系数常被用作结合过程协同性的直接度量。它是探测许多生化系统中反应性质的重要工具。在此，我们分析了现有的实验数据，并证明表征转录因子与其同源位点结合的 Hill 系数实际上可以大于一——这是协同性的标准指示——即使在任何标准协同结合机制缺失的情况下也是如此。通过解析地研究该问题，我们证明了这种效应是由于转录因子与 DNA 分子的结合能无序性以及不同拷贝的转录因子之间的空间位阻相互作用而产生的。我们表明，增强的 Hill 系数意味着占据同源位点所需的转录因子拷贝数显著减少，并且在许多情况下可以解释细胞中转录因子数量的现有估计值。该机制具有普遍性，应适用于其他生物识别过程。