高保真表观遗传：信息论模型预测复制后组蛋白修饰的 $k$ 阈值填充
基因组学
2020-05-15 v1
摘要
除遗传密码外，还存在另一层信息，编码为沿 DNA 定位的组蛋白上的化学修饰。维持这些修饰对细胞的存活与身份至关重要。鉴于只有一半的亲本核小体被转移到每个子代染色质中，组蛋白标记所编码的信息如何被继承是一个谜。我们利用信息论的思想和近期生物学实验的认识来解决此问题。将修饰的复制与重建映射到通信中的等价问题，我们探究若酶机制为理想计算机器，它们能在多大程度上恢复信息。在研究现实酶可发挥作用的参数区间时，我们的分析预测，从实用角度看，酶可能实现一种源于最大后验概率解码的阈值 填充算法。使用我们方法的模拟产生的修饰模式与近期实验观测相似。
引用
@article{arxiv.2005.06539,
title = {High fidelity epigenetic inheritance: Information theoretic model predicts $k$-threshold filling of histone modifications post replication},
author = {Nithya Ramakrishnan and Sibi Raj B Pillai and Ranjith Padinhateeri},
journal= {arXiv preprint arXiv:2005.06539},
year = {2020}
}
备注
11 pages, 6 figures