Hieroglyph:胶质细胞层次化图骨架提取与匹配
图像与视频处理
2019-04-01 v1
摘要
胶质细胞形态的自动三维重建是研究中枢神经系统中小胶质细胞在神经疾病中作用所必需的有力工具。当前的胶质细胞骨架重建技术未能准确捕捉随时间变化的突起追踪,而这对于研究健康和疾病状态下大脑中小胶质细胞的运动性和形态是有用的。我们提出 Hieroglyph,一种针对通过三维多光子显微镜成像的胶质细胞的全自动时序三维骨架重建算法。Hieroglyph 相比最先进的自动骨架重建方法取得了 21% 的性能提升,并在小胶质细胞三维图像数据集上的一致性多种度量中优于最先进水平。该方法所得结果提供了胶质细胞的三维图和数字重建,可用于大量形态学分析,从而影响脑免疫学与疾病研究。
引用
@article{arxiv.1903.12210,
title = {Hieroglyph: Hierarchical Glia Graph Skeletonization and Matching},
author = {Tiffany T. Ly and Tamal Batabyal and Jeremy Thompson and Tajie Harris and Daniel S. Weller and Scott T. Acton},
journal= {arXiv preprint arXiv:1903.12210},
year = {2019}
}
备注
submitted to IEEE International Conference on Image Processing, 2019