细菌与古菌演化中的生境转换
种群与进化
2023-02-02 v1 基因组学
摘要
相关的微生物类群广泛分布于地球的各类生境中，意味着在演化过程中发生了大量的扩散与适应事件。然而，迄今为止，关于这些生境转换的特征与机制所知相对较少，尤其是对于栖息于动物微生物组中的种群。在此，我们综述了涉及多种细菌和古菌谱系间生境转换的现有文献，考量了迁移事件的频率、潜在的环境障碍，以及适应新物理化学条件的机制，包括蛋白质库存与其他基因组特征的改造。依赖微生物宿主的细胞，特别是来自候选门辐射（CPR）的细菌，已多次经历从环境来源向动物微生物组的生境转换。我们将它们的轨迹与自由生活的细胞——包括 Melainabacteria、Elusimicrobia 和产甲烷古菌——以及经历了类似转换的细胞内共生体和噬菌体进行比较。最后我们强调了可能值得未来研究的主要相关课题。
引用
@article{arxiv.2302.00582,
title = {Habitat transition in the evolution of bacteria and archaea},
author = {Alexander L. Jaffe and Cindy J. Castelle and Jillian F. Banfield},
journal= {arXiv preprint arXiv:2302.00582},
year = {2023}
}
备注
Accepted for publication in the Annual Review of Microbiology, Volume 77