环境与种群波动的耦合塑造合作型抗菌耐药性的演化
种群与进化
2023-11-16 v2 统计力学
适应与自组织系统
生物物理
摘要
迫切需要从机理上理解微生物种群如何应对抗菌药物,并寻找可能根除耐药细胞的机制。耐药微生物对抗菌药物的失活常可视为一种合作行为,在大型种群与静态环境中导致耐药与敏感细胞的共存。然而,在微生物群落普遍演化的易变环境中,波动会极大改变这一图景。在此,我们研究由抗菌药物耐药菌株与药物敏感微生物组成、处于时间波动环境中的种群的生态-演化动力学,该环境以随机在丰裕与匮乏状态间切换的承载容量建模。我们假设当耐药细胞数超过某一阈值时,抗菌耐药性是一种共享的公共物品。因此,生态-演化动力学的特征是种群噪声(出生与死亡事件)与环境波动相耦合,后者可引发种群瓶颈。通过分析与计算相结合的手段,我们确定了两菌株长期共存与固定的环境条件,并刻画了一种波动驱动的抗菌耐药性根除机制,其中耐药微生物经历瓶颈直至灭绝。我们还讨论了我们的发现对实验室受控实验的可能应用。
引用
@article{arxiv.2307.06326,
title = {Coupled environmental and demographic fluctuations shape the evolution of cooperative antimicrobial resistance},
author = {Lluís Hernández-Navarro and Matthew Asker and Alastair M. Rucklidge and Mauro Mobilia},
journal= {arXiv preprint arXiv:2307.06326},
year = {2023}
}
备注
21+7 pages, 4+1 figures. The revised version includes minor corrections to the original manuscript. Simulation data and codes for all figures are electronically available from the University of Leeds Data Repository. DOI: https://doi.org/10.5518/1360