巨正则自适应分辨率质心分子动力学：实现与应用
计算物理
2016-05-10 v2 化学物理
摘要
我们已经将质心分子动力学方案(CMD)实现到类巨正则的自适应分辨率模拟分子动力学(GC-AdResS)方法中。我们在两个不同的系统上测试了该实现：极端热力学条件下的液态仲氢和常温条件下的液态水；对参考系统的结构和动力学结果的复现令人非常满意。进行GC-AdResS CMD模拟的能力允许处理具有某些量子特征和开放边界的系统。后一特性不仅具有计算便利性，可给出大得多且计算更昂贵的系统的等效结果，而且提出了一种迄今未被探索的分析工具，即明确识别给定性质所需的基本（量子）自由度。
引用
@article{arxiv.1602.09095,
title = {Grand-Canonical Adaptive Resolution Centroid Molecular Dynamics: Implementation and Application},
author = {Animesh Agarwal and Luigi Delle Site},
journal= {arXiv preprint arXiv:1602.09095},
year = {2016}
}