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离子化脂质综合生成模型:基于蒙特卡尔树搜索的方法

机器学习 2024-12-03 v1 人工智能 生物大分子 定量方法

摘要

离子化脂质是开发有效 messenger RNA(mRNA)递送载体 lipid nanoparticles(LNPs)的关键。虽然传统方法通常耗时,但深度生成模型已成为强大的解决方案,显著加快分子发现进程。然而,实际挑战在于生成的分子结构往往难以或不可行合成。这一项目探索基于蒙特卡尔树搜索(MCTS)的生成模型,用于可合成的离子化脂质。利用可合成脂质构件数据集和两个专门的预测器指导化学空间搜索,我们引入了一个由政策网络驱动的 MCTS 生成模型,能够产生可获取合成路径的新型离子化脂质。

关键词

引用

@article{arxiv.2412.00807,
  title  = {Generative Model for Synthesizing Ionizable Lipids: A Monte Carlo Tree Search Approach},
  author = {Jingyi Zhao and Yuxuan Ou and Austin Tripp and Morteza Rasoulianboroujeni and José Miguel Hernández-Lobato},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2412.00807},
  year   = {2024}
}