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有限大小效应在波兰-舍拉加模型中是否能解释 DNA 解旋的简单模型仿真结果?

统计力学 2009-11-11 v3

摘要

我们将之前的 DNA 解旋仿真结果与波兰-舍拉加模型的预测进行比较。我们聚焦于后者模型的临界区域,计算了该模型中的热力学量以及在仿真中测得的分布函数。我们发现,若 (i) 包括对双链链的开放端的(奇异)加权因子,且 (ii) 保持对有限大小尺度极限的主导修正项,则波兰-舍拉加模型对数据拟合得非常好。控制开放端加权因子的指数 c_1 被较好地确定:0.1 <~ c_1 <~ 0.15。控制大型环长度分布的指数 c 仅被较差地确定。数据与 c 在至少范围 1.9 <~ c <~ 2.2 内的值相容。从数据中不能决定解旋临界点是准一阶还是准二阶。我们建议对双链链的两端均闭合的仿真可能更准确地确定 c。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0502667,
  title  = {Generating Function for Particle-Number Probability Distribution in Directed Percolation},
  author = {Lucian Anton and Hyunggyu Park and Su-Chan Park},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0502667},
  year   = {2009}
}

备注

(v1,2) 8 pages, 5 figures; one-loop calculation corrected in response to criticism received from Hans-Karl Janssen, (v3) content as published