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滤波离子通道记录的完全自动多分辨率理想化:闪烁事件检测

应用统计 2018-02-26 v2

摘要

我们提出一种新的无模型分割方法 JULES,它结合了最近的统计多分辨率技术与局部反卷积,用于离子通道记录的理想化。多分辨率准则考虑了低至采样率的尺度,从而能够检测闪烁事件,即小时间尺度上的事件,甚至低于滤波频率的事件。对于此类小尺度,反卷积步骤允许精确确定驻留时间,尤其是振幅水平,这是常用阈值方法无法完成的任务。这在理论上和一项全面的模拟研究中得到证实。此外,JULES 可用作精细隐马尔可夫分析的预处理方法。我们的新方法使我们能够证明 gramicidin A 闪烁事件与慢速门控事件具有相同的振幅。JULES 作为 R 函数 jules 在 clampSeg 包中可用。

关键词

引用

@article{arxiv.1706.03671,
  title  = {Fully-Automatic Multiresolution Idealization for Filtered Ion Channel Recordings: Flickering Event Detection},
  author = {Florian Pein and Inder Tecuapetla-Gómez and Ole M. Schütte and Claudia Steinem and Axel Munk},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1706.03671},
  year   = {2018}
}