离子通道记录的异质理想化——开放通道噪声
统计方法学
2020-08-07 v1 应用统计
摘要
我们提出一种新的无模型分割方法，用于离子通道记录的理想化。该方法旨在处理测量误差的异质性。这尤其适用于开放通道噪声，而这类噪声通常对无模型方法而言特别难以应对。我们的方法能够处理低通滤波数据，这带来了进一步的计算挑战。为此，我们提出了一种多分辨率检验方法，并结合局部反卷积以解析低通滤波器。模拟与统计理论证实，所提出的理想化方法在存在异质噪声时（即使事件短于滤波器长度）也能非常准确地恢复底层信号。该方法在计算机实验和真实数据上与现有方法进行了比较。我们发现它是唯一能够在两个不同时间尺度上识别PorB孔蛋白开放事件的方法。相关实现以R包形式提供。
引用
@article{arxiv.2008.02658,
title = {Heterogeneous Idealization of Ion Channel Recordings -- Open Channel Noise},
author = {Florian Pein and Annika Bartsch and Claudia Steinem and Axel Munk},
journal= {arXiv preprint arXiv:2008.02658},
year = {2020}
}