通过模拟退火伞形采样第一性原理分子动力学模拟计算质子转移反应的自由能
统计力学
2012-06-05 v1
摘要
提出了一种新的模拟退火方法，称为模拟退火伞形采样，用于计算化学反应的自由能。采用这种模拟退火的第一性原理分子动力学模拟，研究了水溶液中丙二醛的分子内质子转移反应。该方法可以轻松增强反应坐标空间中的构象采样，并准确计算沿反应坐标的自由能。此外，模拟退火伞形采样比传统的伞形采样方法更有效地提供轨迹数据。
关键词
引用
@article{arxiv.1206.0348,
title = {Free energy calculations of a proton transfer reaction by simulated tempering umbrella sampling first principles molecular dynamics simulations},
author = {Yoshiharu Mori and Yuko Okamoto},
journal= {arXiv preprint arXiv:1206.0348},
year = {2012}
}
备注
5 pages, (Revtex4-1), 3 figures