利用 GROMACS 和 LAMMPS 通过爱因斯坦晶体/分子方法计算原子固体的自由能
软凝聚态物质
2012-10-16 v1 化学物理
计算物理
摘要
本文计算了 Lennard-Jones 势和 NaCl 模型的固相自由能。自由能评估采用了爱因斯坦晶体/分子方法，并使用分子动力学程序 GROMACS 和 LAMMPS 进行。将所得结果与蒙特卡洛方法获得的结果进行了比较，发现不同程序和方法之间具有良好的一致性。文中描述了在分子动力学程序中执行固相自由能计算的步骤。由于这些程序允许研究任何连续的分子间势（当以表格形式给出时），本工作表明对于各向同性势（例如描述原子固体或胶体粒子），可以使用 GROMACS 和/或 LAMMPS 常规地进行自由能计算。
引用
@article{arxiv.1210.3956,
title = {Free energy calculations for atomic solids through the Einstein crystal/molecule methodology using GROMACS and LAMMPS},
author = {J. L. Aragones and C. Valeriani and C. Vega},
journal= {arXiv preprint arXiv:1210.3956},
year = {2012}
}