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细胞黏附复合物的强制断裂揭示两种脆性状态间的突变切换

生物大分子 2018-04-04 v1 统计力学 生物物理

摘要

细胞黏附复合物(CACs)由配体结合激活,在许多细胞功能中发挥关键作用,从细胞周期调控到介导细胞与细胞外基质的黏附。受表达于 T 细胞中的白细胞功能相关抗原-1(LFA-1)与细胞间黏附分子(ICAM)结合的单个分子牵拉实验启发,我们使用自组织聚合物(SOP)模型进行恒加载速率(rfr_f)和恒力(FF)模拟,以描述配体从 CACs 断裂的机制。模拟再现了断裂过程动力学的主要实验发现,即最可几断裂力(ff^*s)对 lnrf\ln r_frfr_f 为加载速率)的依赖性呈现两个不同的线性区间。第一个在低 rfr_f 下斜率平缓,而在高 rfr_f 下斜率大得多,尤其对于 LFA-1/ICAM-1 复合物,两者间的转变发生在狭窄的 rfr_f 范围内。从模拟中提取的两个过渡态(TSs)位置显示,从低 rfr_fFF 下的高值到高 rfr_fFF 下的低值发生突变。这种 CACs 从一种脆性(TS 位置在一定的力范围内为常数)状态切换到另一种脆性状态的不寻常行为,在其他蛋白质复合物的强制断裂中未见。我们通过构建自由能形貌 F(Λ)F(\Lambda)s 作为集体反应坐标(Λ\Lambda)的函数来解释这一新颖行为,该函数涉及许多关键带电残基和一个关键金属离子。F(Λ\Lambda) 中的 TS 位置在临界力处突变,表明其为良好的反应坐标,而非分子伸展。我们揭示了 CACs 断裂动力学中观察到的两个加载区间的新机制。

关键词

引用

@article{arxiv.1711.02454,
  title  = {Forced-rupture of Cell-Adhesion Complexes Reveals abrupt switch between two Brittle States},
  author = {Ngo Min Toan and D. Thirumalai},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1711.02454},
  year   = {2018}
}

备注

29 pages, 6 figures, Submitted to J. Chem. Phys