细胞黏附复合物的强制断裂揭示两种脆性状态间的突变切换
生物大分子
2018-04-04 v1 统计力学
生物物理
摘要
细胞黏附复合物(CACs)由配体结合激活,在许多细胞功能中发挥关键作用,从细胞周期调控到介导细胞与细胞外基质的黏附。受表达于 T 细胞中的白细胞功能相关抗原-1(LFA-1)与细胞间黏附分子(ICAM)结合的单个分子牵拉实验启发,我们使用自组织聚合物(SOP)模型进行恒加载速率()和恒力()模拟,以描述配体从 CACs 断裂的机制。模拟再现了断裂过程动力学的主要实验发现,即最可几断裂力(s)对 ( 为加载速率)的依赖性呈现两个不同的线性区间。第一个在低 下斜率平缓,而在高 下斜率大得多,尤其对于 LFA-1/ICAM-1 复合物,两者间的转变发生在狭窄的 范围内。从模拟中提取的两个过渡态(TSs)位置显示,从低 或 下的高值到高 或 下的低值发生突变。这种 CACs 从一种脆性(TS 位置在一定的力范围内为常数)状态切换到另一种脆性状态的不寻常行为,在其他蛋白质复合物的强制断裂中未见。我们通过构建自由能形貌 s 作为集体反应坐标()的函数来解释这一新颖行为,该函数涉及许多关键带电残基和一个关键金属离子。F() 中的 TS 位置在临界力处突变,表明其为良好的反应坐标,而非分子伸展。我们揭示了 CACs 断裂动力学中观察到的两个加载区间的新机制。
引用
@article{arxiv.1711.02454,
title = {Forced-rupture of Cell-Adhesion Complexes Reveals abrupt switch between two Brittle States},
author = {Ngo Min Toan and D. Thirumalai},
journal= {arXiv preprint arXiv:1711.02454},
year = {2018}
}
备注
29 pages, 6 figures, Submitted to J. Chem. Phys