力诱导弹性软化与聚合物仲亲体链的构象转变
软凝聚态物质
2025-11-14 v2
摘要
内在无序蛋白 (IDP) 和聚仲亲体 (PA) 链的力学响应对于理解其生物学功能以及设计功能性材料至关重要。我们利用分子动力学模拟和基于广义随机相位近似 (GRPA) 的理论方法,研究具有不同电荷序列的 PA 链的伸长行为。在伸长力作用下,具有不同电荷序列的两块体 PA 链在弱电静力学耦合下发生连续的卷曲-拉伸转变,而在更强的耦合下转变尖锐化为类似球状-卷曲的转变。GRPA 理论定量地捕捉了这些行为,包括尖锐构象转变及其对电静力学强度的依赖。模拟结果显示,在伸长和松弛过程中存在显著的滞后现象。此外,弹性模数表现为四个 regime:初始平台、应力刚性、指数应力软化行为以及应力刚性 regime。利用该理论模型和 PA 链的结构输入,我们证明弹性软化 regime 中的弹性模数随力 的函数呈指数衰减,,与模拟结果一致。PA 链的弹性响应进一步在不同电荷序列下进行了考察,在电荷块长度较小时不存在显著的弹性软化和尖锐转变。最后,粗粒度模型的 IDP 如 LAF-1 和 DDX4 也表现出类似的非线性弹性行为,凸显了这些机制的普适性。我们的结果在电荷序列、电静相关性和非线性弹性之间建立了基本联系,桥接了分子相互作用和宏观力学。
引用
@article{arxiv.2511.09514,
title = {Force-induced Elastic Softening and Conformational Transitions in a Polyampholyte Chain},
author = {Rakesh Palariya and Sunil P. Singh},
journal= {arXiv preprint arXiv:2511.09514},
year = {2025}
}
备注
19 pages, 16 figures