折叠或死亡:体外实验进化
种群与进化
2012-11-20 v1 生物大分子
摘要
我们介绍了一个实验进化系统,由在改良的定量聚合酶链反应 (qPCR) 中进化的短寡核苷酸群体(Oli 群体)组成。该系统在遗传、基因组、表型和适应度水平上均可处理。Oli 系统使用设计的 DNA 发夹结构,使其在限定条件下能够自引发。选择作用于自引发的表型,随后利用 qPCR 放大并量化适应度差异。我们在此概述了 Oli 系统的方法学和生物信息学工具,并通过在不同环境变化速率下调查适应性进化的实验进行试运行,证明其可用作常规的实验进化模型系统。
引用
@article{arxiv.1211.4223,
title = {Fold or die: experimental evolution in vitro},
author = {Sinéad Collins and Andrew Rambaut and Stephen J. Bridgett},
journal= {arXiv preprint arXiv:1211.4223},
year = {2012}
}
备注
20 pages, 4 figures, 1 table, 2 supplementary tables