具有表观遗传表型切换的细胞种群动力学中的适应度与熵产生
种群与进化
2014-08-04 v2
摘要
受近期对基因表达、生化信号传导及自发可逆表观遗传切换的随机性理解的启发,我们研究了一种简单的确定性细胞种群动力学,其中亚群以不同速率增长,且单个细胞可在少量不同的表观遗传表型之间双向切换。过去的两种理论,即主方程的种群动力学和热力学,分别在数学术语中定义了两个重要概念:前者中的适应度 (fitness) 和后者中的(非绝热)熵产生 (entropy production)。两者均在细胞种群动力学的演化中扮演重要角色。切换维持了亚群增长的变异,从而确保持续的自然选择。作为 Price 方程的一种形式,适应度的增加源于:(i) 通过变异进行的自然选择,以及 (ii) 人均增长与切换之间的正协方差,这代表了一种拉马克式行为。负协方差则在适应度稳态(即“红皇后”情景)中平衡自然选择。同时,增长使亚群比例远离单个细胞的“内在”切换平衡,从而导致持续的熵产生。人均增长率与亚群“化学势”之间的协方差则抵消了熵产生。针对增长主导切换及反之的极限情况,我们获得了分析结果。
引用
@article{arxiv.1309.1898,
title = {Fitness and entropy production in a cell population dynamics with epigenetic phenotype switching},
author = {Hong Qian},
journal= {arXiv preprint arXiv:1309.1898},
year = {2014}
}
备注
16 pages