Fetpype：用于可复现胎儿脑 MRI 分析的开放源代码流水线
图像与视频处理
2026-02-04 v2
摘要
胎儿脑磁共振成像（MRI）对于评估子宫内神经发育至关重要。然而，胎儿 MRI 分析在技术上仍然具有挑战性，原因包括胎儿运动、低信噪比以及需要复杂的多步骤处理流水线。这些流水线通常包括运动校正、超分辨率重建、组织分割和皮层表面提取。虽然每个单独的处理步骤都有专门的工具，但将它们集成到一个稳健的、可复现的、用户友好的端到端工作流中仍然很困难。这种碎片化限制了跨研究的可复现性，并阻碍了先进的胎儿神经影像方法在研究和临床环境中的采用。Fetpype 通过提供一个标准化、模块化和可复现的框架来解决这一差距，使研究人员能够在统一的工作流中将原始 T2 加权采集处理到派生的体积和基于表面的输出。Fetpype 在 GitHub 上公开可用，地址为 https://github.com/fetpype/fetpype。
引用
@article{arxiv.2512.17472,
title = {Fetpype: An Open-Source Pipeline for Reproducible Fetal Brain MRI Analysis},
author = {Thomas Sanchez and Gerard Martí-Juan and David Meunier and Miguel Angel Gonzalez Ballester and Oscar Camara and Elisenda Eixarch and Gemma Piella and Meritxell Bach Cuadra and Guillaume Auzias},
journal= {arXiv preprint arXiv:2512.17472},
year = {2026}
}
备注
6 pages, 1 figure; submitted to the Journal of Open Source Software (JOSS)