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基于图谱的胎儿与新生儿脑分割及分析自动流水线

计算机视觉与模式识别 2024-11-20 v1 定量方法

摘要

磁共振成像(MRI)中围产期脑结构的自动分割对于脑生长及相关并发症的研究至关重要。尽管针对成人与儿童 MRI 数据存在不同方法,但缺乏用于围产期影像分析的自动工具。本工作中,我们开发了一条用于胎儿与新生儿分割的新流水线。我们也报告了两个新胎儿图谱的创建,以及它们在流水线中基于图谱的分割里的使用,这些基于新颖的配准方法。该流水线还能够提取皮层与软膜表面并计算诸如曲率、厚度、沟深与局部脑回化指数等特征。结果表明,与专家标注相比,新模板与我们分割策略的引入带来了准确结果;且与参考流水线(发育中人脑连接组计划(dHCP))相比,对于早发与晚发胎儿脑均具有更优性能。

关键词

引用

@article{arxiv.2205.07575,
  title  = {An automatic pipeline for atlas-based fetal and neonatal brain segmentation and analysis},
  author = {Andrea Urru and Ayako Nakaki and Oualid Benkarim and Francesca Crovetto and Laura Segales and Valentin Comte and Nadine Hahner and Elisenda Eixarch and Eduard Gratacós and Fàtima Crispi and Gemma Piella and Miguel A González Ballester},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2205.07575},
  year   = {2024}
}