基于潜类别模型评估 SARS-CoV-2 诊断检测流程：依据丹麦国家登记数据对抗原检测试剂盒与 PCR 检测采样的比较
定量方法
2021-12-22 v1
摘要
抗原检测试剂盒已在世界范围内冠状病毒（SARS-CoV-2）大流行期间被广泛用作筛查工具。尽管通常认为采集样本进行 PCR 检测比使用抗原检测试剂盒所得结果更可靠，但两种方案在实地中的总体灵敏度与特异度尚未在不假定 PCR 检测为金标准的情况下被估计。我们利用丹麦国家登记数据，通过潜类别模型估计 PCR 与抗原检测在实地中的表现。结果基于从 2021 年 2 月至 2021 年 6 月丹麦获得的 5500 万份检测结果中二次筛选出的 24 万份配对检测结果。我们发现本数据样本中两种检测的特异度均极高（>99.7%），而 PCR 采样的灵敏度估计为 95.7%（95% CI：92.8-98.4%），研究期间丹麦所用抗原检测试剂盒的灵敏度估计为 53.8%（95% CI：49.8-57.9%）。我们的发现可作为实施连续检测策略时的补充参考信息，例如丹麦所采用的在抗原试剂盒阳性后以 PCR 样本确认的 policy。我们注意到，尽管该策略减少了抗原筛查相关的假阳性数，却也增加了假阴性。我们证明，仅当预期真实患病率较低时，以假阴性换取假阳性的权衡才有利于连续检测的使用。由于该期间阳性结果相对较少，我们的灵敏度估计存在显著不确定性：因此在患病率更高的人群中验证我们的发现对未来工作极具意义。
引用
@article{arxiv.2112.11298,
title = {Evaluation of diagnostic test procedures for SARS-CoV-2 using latent class models: comparison of antigen test kits and sampling for PCR testing based on Danish national data registries},
author = {Jacob Stærk-Østergaard and Carsten Kirkeby and Lasse Engbo Christiansen and Michael Asger Andersen and Camilla Holten Møller and Marianne Voldstedlund and Matthew J. Denwood},
journal= {arXiv preprint arXiv:2112.11298},
year = {2021}
}