巨 DNA 构象滞后的阐明
软凝聚态物质
2009-11-13 v1
摘要
通过实验和理论方法研究了本体溶液中由缩合剂介导的巨 DNA 的构象行为。实验上，通过分别增加和减少缩合剂 PEG（聚乙二醇）的浓度，在折叠和去折叠过程中观察到了显著的构象滞后现象。为阐明观察到的滞后现象，利用蒙特卡洛模拟研究了半柔性链模型的线团 - 球粒转变。模拟结果显示，对于足够刚性的链会出现滞后回线，表明折叠和去折叠过程存在不同的路径。此外，我们的结果表明，在滞后回线内，球粒态在热力学上比线团态更稳定。我们的发现表明，增加链的刚性可能会减少与折叠路径相关的链构象，从而阻碍折叠过程。
引用
@article{arxiv.0705.0684,
title = {Elucidation of Conformational Hysteresis on a Giant DNA},
author = {Chwen-Yang Shew and Yuji Higuchi and Kenichi Yoshikawa},
journal= {arXiv preprint arXiv:0705.0684},
year = {2009}
}
备注
21 pages, 7 figures