膜表面脂质的电扩散
定量方法
2015-06-03 v2 软凝聚态物质
偏微分方程分析
生物物理
摘要
脂质和蛋白质的随机横向易位是膜表面的普遍过程。当这种横向随机扩散受到静电相互作用和膜曲率介导时,可诱导脂质和蛋白质的局部聚集或组织化。尽管已测量了不同组成膜上脂质的横向扩散速率,并可计算预定蛋白质-膜-脂质系统的静电自由能,但聚集过程及向静电有利状态的演化仍未确定。本文基于自由能泛函的变分原理,提出一个电扩散模型,用于描述膜表面多种带电脂质的自洽横向漂移-扩散。模型中考虑了脂质的有限尺寸,以施加膜表面脂质浓度的几何约束。我们开发了一种曲面有限元方法,以适配模型偏微分方程(PDEs)中的Laplace-Beltrami算子。该模型恰当地描述了膜表面脂质的饱和现象,并正确预测了MARCKS肽可通过其碱性氨基酸残基持续螯合三个多价磷脂酰肌醇4,5-二磷酸(\pip2)脂质,即使膜中存在大量单价磷脂酰丝氨酸(PS)。偏微分方程的解还显示了脂质螯合的盐依赖性。
引用
@article{arxiv.1111.7070,
title = {Electrodiffusion of Lipids on Membrane Surfaces},
author = {Y. C. Zhou},
journal= {arXiv preprint arXiv:1111.7070},
year = {2015}
}