非平稳神经时间序列的高效转移熵分析
信息论
2015-11-24 v2 math.IT
神经元与认知
摘要
信息论允许我们从信息传递、存储和修改的角度研究神经系统中的信息处理。尤其是作为信息传递度量的转移熵,在神经科学中引起了极大的关注。从两个过程估计转移熵需要观测这两个过程的多次实现,以估计相关的概率密度函数。为了获得这些观测,现有的估计器假设过程是平稳的,以便允许随时间汇集观测结果。然而,这一假设是这些估计器在神经科学中应用的主要障碍,因为观测到的过程通常是非平稳的。作为解决方案,Gomez-Herrero 及其同事从理论上表明,可以通过从实现集合中估计转移熵来避免平稳性假设。这种集合在神经科学实验中通常以实验试次的形式 readily available。因此,在这项工作中,我们将集合方法与最近提出的转移熵估计器相结合,使转移熵估计适用于非平稳时间序列。我们提出了一种高效的实现方法,以应对集合方法实际应用中增加的计算需求。具体而言,我们使用针对图形处理单元的大规模并行实现,来处理集合方法中计算量最大的部分。我们在模拟随机过程的数据上测试了实现的性能和鲁棒性,并展示了该方法在脑磁图数据上的适用性。虽然我们主要针对神经科学数据评估所提出的方法,但我们期望它适用于涉及分析复杂生物、社会和人工系统中信息传递的众多领域。
引用
@article{arxiv.1401.4068,
title = {Efficient transfer entropy analysis of non-stationary neural time series},
author = {Patricia Wollstadt and Mario Martínez-Zarzuela and Raul Vicente and Francisco J. Díaz-Pernas and Michael Wibral},
journal= {arXiv preprint arXiv:1401.4068},
year = {2015}
}
备注
27 pages, 7 figures, submitted to PLOS ONE