用于玻璃-堵塞转变研究的的高效$d$维分子动力学模拟
软凝聚态物质
2022-05-18 v2
摘要
我们开发了一种适用于空间维数并行分子动力学模拟的算法，并描述了其在C++中的实现。所有例程在任意下均可工作；可模拟的最大仅受可用计算资源限制。这些例程包括几个对玻璃/堵塞转变研究特别有用的例程，例如SWAP蒙特卡洛和FIRE能量最小化。模拟运行时间随粒子数和模拟线程数的标度与LAMMPS等流行MD代码相当。高效的并行实现使得模拟比以往高维玻璃转变研究中所用系统大得多的系统成为可能。作为代码能力的演示，我们表明过冷液体可具有显著更异质的动力学，并经历比先前报道强得多的Stokes-Einstein关系失效，至少部分归因于早期模拟中采用的远小得多的系统尺寸。
引用
@article{arxiv.2112.12271,
title = {Efficient $d$-dimensional molecular dynamics simulations for studies of the glass-jamming transition},
author = {Robert S. Hoy and Kevin A. Interiano-Alberto},
journal= {arXiv preprint arXiv:2112.12271},
year = {2022}
}