时间网络上新菌株出现的动力学
物理与社会
2018-05-14 v1 种群与进化
摘要
网络上的多菌株竞争在许多情境中被观察到,包括传染病生态学、信息传播或对流行病的行为适应。尽管已有大量研究考虑静态、时间聚合网络,但当网络的连边随时间建立与销毁时,理解并发菌株的传播仍是一项挑战。在此,我们分析当初始地方流行菌株与新兴菌株均遵循易感-感染-易感动力学、且以可与网络演化时间尺度相比的速率传播时,网络动力学如何塑造两者竞争的结果。利用医院收治患者与医疗护理人员之间近距离接触的时序数据,我们分析时间模式与初始条件对优势图与共存时间的影响。我们发现活动量的强烈波动使得新兴菌株取代地方流行菌株的概率对出现时间高度敏感。网络的时间结构塑造了优势图,在给定流行病学参数集下,经验网络与其随机化版本中观察到的取代概率存在显著变化。我们的工作有助于描述时间网络上竞争病原体之间的复杂相互作用。
引用
@article{arxiv.1805.04343,
title = {Dynamics of new strain emergence on a temporal network},
author = {Sukankana Chakraborty and Xavier R. Hoffmann and Marc G. Leguia and Felix Nolet and Elisenda Ortiz and Ottavia Prunas and Leonardo Zavojanni and Eugenio Valdano and Chiara Poletto},
journal= {arXiv preprint arXiv:1805.04343},
year = {2018}
}
备注
9 pages, 4 figures