特异性DNA-蛋白质相互作用中氢键耦合的动力学
软凝聚态物质
2016-07-07 v1 斑图形成与孤子
生物大分子
摘要
我们提出一个描述DNA与特异性结合蛋白之间涉及长距离传递的相互作用的动力学模型。该动力学依赖于DNA与蛋白质之间以及碱基对之间形成的氢键的耦合，因为这二者决定了结合的位点特异性。我们采用带耦合项的Morse势来构造哈密顿量。该模型产生一种呼吸子激发，对应于DNA气泡的形成，其作为遗传信息的载体而传播。我们考察了各类可能的耦合动力学，并表明该模型在描述复性或杂交过程方面的可行性。
引用
@article{arxiv.1607.01608,
title = {Dynamics of Hydrogen Bonds Coupling on the Specific DNA-Protein Interactions},
author = {Donny Dwiputra and Wahyu Hidayat and Freddy Permana Zen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.01608},
year = {2016}
}