抗生素耐药性是在医院内演化的吗？

医院内细菌暴发已有充分文献记载。基于这些事件以及医院中抗生素的大量使用，人们一直假设抗生素耐药性是在医院环境中演化的。为检验这一假设，我们研究了一家社区医院在2.5年期间从患者分离株中收集的细菌耐药表型。图形模型分析显示，除入院时间外，耐药性与患者信息之间无关联。这使我们能够聚焦于时间进程数据。我们引入了一个基于负二项延迟的医院传播模型。我们的主要贡献是一种名为“院内耐药演化检测器（NERD）”的统计假设检验方法。该方法可计算医院内发生的耐药趋势的显著性，能告知医院工作人员各种实践与干预措施的效果，有助于检测克隆暴发，并已作为R包提供。我们将NERD方法通过16项假设检验应用于研究中的16种抗生素。对于其中13种抗生素，我们发现医院环境对耐药性的演化无显著影响；医院仅仅是更大图景中的一部分。另外三种抗生素（头孢吡肟、头孢他啶和庆大霉素）获得的p值表明，在医院实践中应特别关注这些抗生素。其中一种，头孢他啶，在考虑多重假设检验后仍具有显著性，表明该药物的耐药性呈下降趋势。