大肠杆菌潜在途径的非必需性
分子网络
2011-03-29 v1 无序系统与神经网络
适应与自组织系统
生物物理
摘要
对单细胞生物进行的基因敲除实验已确定，相当一部分基因的表达并非最佳生长所必需。最近发现，大肠杆菌在环境和遗传扰动后会暂时激活大量潜在代谢途径，这一问题获得了新的维度，这提示暂时激活的反应会影响生长，从而促进在扰动下的适应。本文中，我们通过计算检验了这一假设，并惊奇地发现，潜在途径的可用性始终不提供生长优势，反而在遗传扰动后倾向于抑制生长。即使对于在替代条件下具有已知功能的潜在途径，这一点也成立，从而将这种不利影响的意义扩展到明显非必需基因之外。这些发现提出了一种可能性，即潜在途径的激活实际上是另一种（可能是次优的）适应性反应的衍生结果。
引用
@article{arxiv.1103.5176,
title = {Dispensability of Escherichia coli's latent pathways},
author = {Sean P. Cornelius and Joo Sang Lee and Adilson E. Motter},
journal= {arXiv preprint arXiv:1103.5176},
year = {2011}
}