差异疏水性驱动亨廷顿舞蹈症的自我组装
生物大分子
2009-11-10 v1
摘要
确定 huntingtin-exon1（亨廷顿舞蹈症进展的密切标志物）缔合驱动力与机制，是寻找潜在药物靶点乃至最终治愈的重要前提。我们在此引入一个基于 exon1 片段与嵌段共聚物理化学性质关键类比的建模框架。我们采用基于耗散粒子动力学的系统介观方法，该方法能够克服动力学势垒，从而捕捉比以往考虑的更大系统在更长时间上的动力学。我们的结果揭示，相对于 exon1 片段其余部分（基于脯氨酸）的聚谷氨酰胺区块的相对疏水性——迄今被忽视——构成了自组装过程起始的主要因素。我们发现组装受 exon1 浓度和聚谷氨酰胺伸展长度共同支配，即便在我们考虑的最低体积分数下也存在较低的缔合长度阈值。此外，这种自缔合无论谷氨酰胺伸展处于无规卷曲还是发夹构型均会发生，分别导致球形或圆柱形组装体。我们讨论了这些结果对重新解释该背景下现有研究的意义，包括 exon1 的聚集途径可能不同于被广泛研究的同聚聚谷氨酰胺肽。
引用
@article{arxiv.q-bio/0309017,
title = {Differential hydrophobicity drives self-assembly in Huntington's disease},
author = {Martin G. Burke and Rudiger Woscholski and Sophia N. Yaliraki},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0309017},
year = {2009}
}