面向集成图像分析平台以实现显微成像数据全球共享的本体构建
数字图书馆
2021-11-23 v1 图像与视频处理
定量方法
摘要
成像数据是当前生命科学中最重要的基础之一。我们旨在构建一种本体来描述成像元数据，作为集成了光学与电子显微镜图像及各种生物实体的数据库的数据模式。为此，我们将资源描述框架（RDF）应用于开放显微镜环境（OME）数据模型，该模型是描述光学显微镜图像与实验数据的实际标准。我们将基于 XML 的 OME 元数据转化为 RDF 模式的基本概念，作为开发显微镜本体的尝试。在该本体中，我们提出了 18 个上层概念，包括 OME 中缺失的概念，如电子显微镜、表型数据、生物样本和成像条件。
引用
@article{arxiv.2110.10407,
title = {Development of an Ontology for an Integrated Image Analysis Platform to enable Global Sharing of Microscopy Imaging Data},
author = {Satoshi Kume and Hiroshi Masuya and Yosky Kataoka and Norio Kobayashi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2110.10407},
year = {2021}
}