检测 Fyn SH3 蛋白突变后残留本态熵变化
生物大分子
2026-05-18 v2
摘要
NMR 松弛实验表明，Fyn SH3 域中存在小但可测量的本态动力学变化，与通过其他氨基酸取代本疏水核心中的苯丙氨酸残基(F20)相关。我们在此使用 NMR order parameters 的实验值作为野生型蛋白及两种突变变体(F20L 和 F20V)的约束，在分子动力学模拟中进行约束。该方法高度灵敏，提供关于伴随突变导致的本态润动细微变化的原子分辨率描述。我们确定的结构集合允许估计由每种突变导致的本态熵变化。这些熵变化对应数 kcal/mol 的自由能变化，因而代表了与氨基酸突变相关联整体稳定性变化的可观贡献。
引用
@article{arxiv.2605.14496,
title = {Detection of residual native state entropy changes upon mutation in Fyn SH3},
author = {Kresten Lindorff-Larsen and Robert B. Best and Anthony Mittermaier and Lewis E. Kay and Christopher M. Dobson and Michele Vendruscolo},
journal= {arXiv preprint arXiv:2605.14496},
year = {2026}
}
备注
26 pages, 4 figures