人类干细胞使用的基因表达设计原理；对多能性的启示
定量方法
2007-05-23 v1 其他定量生物学
摘要
人类胚胎干细胞（ESC）是未分化的，并具有自我更新和多能分化的能力。成体干细胞更新其自身组织，但它们是否能转分化为其他组织仍存在争议。为了理解干细胞多能性背后的遗传程序，我们将ESC的转录谱与人类造血和角质形成细胞来源的祖/干细胞及其成熟细胞的转录谱进行了比较，并将其视为组织分化过程中的快照。ESC基因谱显示出更高的复杂性，高表达基因显著多于成体细胞。我们假设ESC采用一种策略，即表达代表各种分化途径的基因，并在分化到特定目标时仅选择少数基因持续表达。这种策略可能对ESC的多能性是必要的。造血或角质形成细胞的祖细胞也遵循同样的设计原理。使用先进的聚类方法，我们表明许多ESC表达的基因在祖/干细胞中被关闭，随后在成体组织中进一步下调。同时，目标组织特异性基因在向皮肤或血液的成熟细胞分化过程中上调。
引用
@article{arxiv.q-bio/0409015,
title = {Design Principle of Gene Expression Used by Human Stem Cells; Implication for Pluripotency},
author = {Michal Golan-Mashiach and Jean-Eudes Dazard and Sharon Gerecht-Nir and Ninette Amariglio and Tamar Fisher and Jasmine Jacob-Hirsch and Bella Bielorai and Sivan Osenberg and Omer Barad and Gad Getz and Amos Toren and Gideon Rechavi and Joseph Eldor-Itskovitz and Eytan Domany and David Givol},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0409015},
year = {2007}
}
备注
To appear in FASEB Journal; 32 pages