用于验证生物分子网络的设计实验

在分子和合成生物学中，使用机理（非机器学习）模型设计生物分子网络呈增长趋势。一旦设计完成，这些网络需要通过实验结果进行验证，以确保理论网络正确建模了真实系统。然而，这些实验可能昂贵且耗时。我们提出一种设计实验方法以高效验证这些网络。利用高斯过程构建实验结果与设计响应之间偏差的概率模型，然后采用贝叶斯优化策略选择下一个采样点。我们比较了不同的设计准则，并基于量化整个表面上该偏差及其不确定性的度量开发了停止准则。我们在生化过程的计算机模型模拟数据上测试了我们的策略。