中文

非平衡路径的密度依赖分析改进了自由能估计

统计力学 2009-05-29 v2

摘要

当一个系统通过修改哈密顿量的时间依赖协议被驱动远离平衡时,它会遵循一条非平衡路径。这些路径的样本可用于非平衡功定理来估计平衡量,例如自由能差。在这里,我们考虑使用一种协议分析由另一种协议生成的路径。我们假设,最小化非平衡密度与瞬时平衡密度之间滞后(差异)的分析协议将减少再处理轨迹的耗散,并导致更好的自由能估计。事实上,当基于精确可解传播子或相对熵的最小滞后分析协议应用于几个测试案例时,观察到估计的自由能差的准确性和精度有显著提高。

关键词

引用

@article{arxiv.0901.3369,
  title  = {Density-Dependent Analysis of Nonequilibrium Paths Improves Free Energy Estimates},
  author = {David D. L. Minh},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0901.3369},
  year   = {2009}
}

备注

12 pages, 6 figures. Expanded and clarified from original version. To appear in J. Chem. Phys